生物食品与环境学院实验实训中心现拥有面积5000多平方米实验室，仪器设备4000余台套，总价值5000余万元，其中有原子分光光度计、高效液相-质谱联用仪、气相色谱仪、TOC测定仪、元素分析仪、红外分光光度计、高效液相色谱仪、蛋白质纯化仪等大型精密仪器30余台。现有3个省级实验室（实训中心）：污水净化与生态修复材料安徽省重点实验室，虚拟仿真实验教学中心，发酵工程及应用实训（实验）中心和2个院级重点实验室：发酵工艺开发与应用实验室和应用酶学与工程实验室。共设置教学实验室45间，其中一楼发酵工程实验室、固废处理工程实验室、水处理工程实验室、四大名点实验室、啤酒生产实训中心等实验室，主要为工程类实验室；四楼主要为公共平台实验室（培养室、灭菌室、菌种室等）和专业实验室（基因工程实验室、食品生物技术实验室、酶工程实验室等）以及分析测试实验室；五楼为环境工程和食品类专业实验室以及科研平台和分析测试室等。
实验实训中心拥有专职管理人员13人，其中高级实验师4人。另有教师兼职管理人员近10人。专职实验人员具有扎实的专业理论水平和丰富的实践能力，能独立承担多门课程的实验教学，多位教师主持或参与省、市和学院纵向、横向科研项目。
实验实训中心每学年承担全院四个专业实验教学任务和300余人本科生毕业论文。并为院科研活动与大学生创新创业、挑战杯、第二课堂等提供支持。
实验实训中心先后承担了国家自然科学基金项目；国家水专项子课题；国家固废专项子课题；安徽省科技厅自然科学基金项目，安徽省科技厅攻关项目；安徽省教育厅自然科学项目。获安徽省科技进步奖三等奖，安徽省教学成果奖二等奖。